既然決心成爲梟雄，那就必須鐵血無情。殺死了自己的兩個叔父諾顏烏巴什、布顏布爾罕後，蘇勒坦立即命心腹羅卜藏、那日鬆率軍接管了二人的部衆，又命人將叔父的家眷流放到鐵門關。
自覺坐穩了大臺吉的寶座，十三歲的少年便想飛了，他要改革，想以大明朝的官制改革蒙古。
大明朝的官制好！以內閣爲最高行政機構，下設六部（吏戶禮兵刑工）、三府（五軍都督府、宗人府、詹事府）、五寺（大理寺、太常寺、光祿寺、鴻臚寺、太僕寺）、兩監（國子監、欽天監）、一司（通政使司）、三院（翰林院、都察院、太醫院）；地方設省、府、縣三級，各省設三使司衙門，其上又有總督、巡撫。
然而，路漫漫其修遠兮，改革會觸犯蒙古諾顏們的利益。這些諾顏在自己的領地都是土皇帝，個個有兵，弄不好便會激起反叛，狼煙四起。
治大國若烹小鮮，蘇勒坦懂得這一點。先是造勢，讓手下大力鼓吹“恢復大元舊制”。明朝的官制來源於元朝，最大的不同是罷宰相職，以內閣代之；地方上則將五花八門的中書省、宣慰使司、諸路萬戶府、諸路總管府、散府、諸州、諸縣、諸軍簡化爲省、府、縣三級。所謂“恢復大元舊制”，其實是披着羊頭賣狗肉，要搞大明朝的那一套。
衛拉特的官制從北元演化而來，中樞層級其實已經有了與大明類似的職能，比如，圖什墨爾相當於閣臣，扎爾固齊相當於六部之長；關鍵在於地方，大大小小的諾顏掌控着地方軍政大權，中央對地方的掌控力弱。
不過，造勢歸造勢，蘇勒坦並沒有急着向各地的鄂托克派出官員，將諾顏們的權力收歸中央。而是雷聲大，雨點小，僅在大臺吉的直屬領地試行改革。自己的領地，想怎麼改便怎麼改，誰也說不出什麼。
先改革中樞。設置內閣，以三位圖什墨爾（參決政事之臣）：巴圖和坦、鐵鉬爾、那蘇圖爲閣臣，巴圖和坦爲首輔，鐵鉬爾爲次輔；又設吏、戶、禮、兵、刑、工六部，將原先的三名扎爾固齊增補爲六人，各管一部，稱尚書；其餘官員皆仿明制，不過因爲人口較少，很多官職暫未設立。
蒙古人習慣了舊制，忽然冒出許多新鮮的官職來，自然有些不適應。可是因爲到處都在宣傳，大元朝當年就是實施的三省六部制，大臺吉如今是在恢復大元舊制，誰若是反對，便是不愛大元、不忠於蒙古。這麼一宣傳，反對的聲音便小了。說到底，中樞各官本來就是大臺吉的屬官，大臺吉改革自己王庭的官制，並沒有觸犯諾顏們的利益，他們自然沒必要反對。很多諾顏不但不反對，反而高聲稱讚蘇勒坦“恢復大元舊制”是鴻圖大展、志存高遠。
見第一步邁得還算順利，蘇勒坦暗舒一口氣，小心翼翼地推行地方層級改革。
他的第二把火燒向了自己的直屬領地。裕勒都斯、叉力失、庫車這三個府，老父親已經改革完畢，設了知府、知縣等官，無需再改。剩下的便是直屬牧地了。他將自己的直屬牧地劃分爲五個鄂托克，實行軍政分離，以千戶長專管軍事，宰桑專管民政，德木齊管司法，收楞額管稅收。最大的特色便是在鄂托克內増設千戶長一職掌軍，取消了宰桑的軍權；其次，德木齊、收楞額等屬官，雖然仍爲宰桑屬官，卻由吏部考覈任命。這便大大加強了中央集權。
第三把火按說應該燒向輝特部內的鄂羅哩克、納木佔、阿勒達爾、額爾克等臺吉。
在各自的鄂托克內，他們既擔任着宰桑，又掌管着軍事，還可以任命德木齊、收楞額等屬官，權力太大，容易尾大不掉！
可真要動手時，蘇勒坦卻猶豫了。這些臺吉可不好惹，逼急了是要率兵造反的。思來想去，決定溫水煮青蛙、慢慢來，仍讓他們兼任宰桑、千戶長二職，只將鄂托克內的稅收權、司法權收回。規定鄂托克內的司法官（德木齊）、收稅官（收楞額）不再由宰桑任免，而是由吏部任免。爲了安撫這些諾顏，又規定這些臺吉可以世代擔任各自鄂托克的宰桑、千戶長二職。
忙完這些，便開始完善軍制。軍隊是蘇勒坦的命根子，一定要改革，使其適應戰爭的需要。 如今的衛拉特軍制，仍然維持着成吉思汗時代的老傳統。軍隊多由各愛瑪克、鄂托克的諾顏們在戰時臨時徵召。因爲缺少常備軍，所以軍隊的訓練不足。好在蒙古勇士自幼在馬背上長大，他們的勇猛彪悍彌補了訓練不足的缺點。
征服了叉力失、庫車二府，又蕩平了內亂，如今自己的屬民達到了三十多萬，是時候建立一支常備軍鞏固統治了。有兵才能做王嘛！
蘇勒坦的劍眉微顫，下定了決心。
他宣佈建立一支一萬人的禁衛軍，駐守各處要地。十人爲什，設十戶長；三什爲隊，設三十戶長、副三十戶長；三隊百人爲哨，設百戶長、副百戶長、哨鎮撫（軍紀官）；三哨爲總，設都百戶、副都百戶、總鎮撫；三總千人爲營，設千戶長、副千戶長、營鎮撫；三營爲旗，設都千戶、副都千戶、鎮撫使、糧秣轉運使（六品，管文書輜重）；三旗萬人爲鎮，設萬戶長、副萬戶長、都鎮撫使、都糧秣轉運使。
爲了增加蒙古人的認同感，他以成吉思汗的“怯薛軍”來爲這支禁衛軍命名，並自任怯薛軍萬戶長。在裕勒都斯府駐紮了八千人，叉力失、庫車各駐紮千人。
又在裕勒都斯府編練一千步兵，在叉力失、庫車各編練三千步兵，每鄂托克編練一百騎兵，這些地方軍隊，軍餉比禁衛軍低，人數大約八千，統稱爲“守備軍”，各設守備管轄。
忙完這些，蘇勒坦大臺吉總算初步完成了在輝特部內部的中央集權，鞏固了自己的大臺吉之位。野心勃勃的他，每日秣馬勵兵，準備着征服世界。