在里根擔任美國總統期間，美國政府被聯邦調查局、中央情報局、國家安全局和美國緝毒局組成的秘密組織所掌控，世界因此分崩離析。這個影子組織被稱爲 The Gang of Four，暗中操控美國政府，並大力宣揚「利益大於人民」，最終導致美國走向了分裂。
這個即將粉碎的超級大國因爲在南美洲開展所謂「打擊草藥戰爭」而陷入泥潭。這場戰爭本質上是爲了搶奪智利與玻利維亞的鋰礦資源，但他們沒有告訴公衆投入使用了基因編程病毒來扼殺草藥的生長，進而讓全球草藥商無貨可賣。此舉導致秘密資助草藥商的歐洲超級企業的不滿，曠日持久的衝突在西方世界積怨已久，最終在 1993年，哥倫比亞毒販在曼哈頓引爆了一顆手提核彈。
第二年，美國被曝出利用全球市場來洗白通過非法武器交易獲得的資金，從而導致全球經濟崩潰。90年代晚期，因爲接連不斷的戰爭和經濟衰退，再加上流行病和自然災害肆虐，其中包括一場 10.5級的大地震，導致洛杉磯 30 %的土地被海水淹沒，所有的一切讓這個國家滿目瘡痍。四分之一的人們無家可歸，大部分城市都遭到荒廢，一個流浪而居的羣體應運而生，他們就是「流浪者」，同時還誕生了一羣義體改造成癮的怪人。隨着憲法廢除，全國進入戒嚴狀態，加利福利亞和德克薩斯等州宣佈脫離聯邦成爲「自由邦」。
二十世紀末，美國之外的世界其他地區情況要稍微好一點，但也只好一點。幾個亞太地區國家，特別是中國、韓國與日本都還基本保持穩定，歐盟（在這個世界中被稱爲「聯合歐洲」）也同樣保持穩定，所以歐元隨後成爲世界貨幣。南美洲從美國失敗的帝國主義侵略中恢復了元氣，但俄羅斯卻變成了一個強盜主義的國家，全球範圍內爆發瘟疫和饑荒，中東地區因爲小規模核戰爭而變成了一片充滿放射塵埃的輻射廢土。
跨國巨型企業無疑是全球災難最好的清道夫。大大小小的政府隨時可能崩潰，他們不得不尋求超級企業的援助才能運轉下去。爲了換取更多權力和影響力，企業自然是非常樂意幫忙。在 2000年代早期，這些企業在第一世界國家中開始了自己的行動，掌控了許多國家的政府以及資源。其中最有權勢的幾家公司包括，能源巨頭 PetroChem、對應的蘇聯能源巨頭 SovOil，生物科技公司 BioTechnica、武器製造商軍用科技以及「以私人軍事業務爲主，但幾乎無所不能的」荒阪集團。除此之外還有許多體量稍小的集團公司。
但這並不代表着千禧一代的沉淪。這時中非國家聯合在一起，發展出了非常成功的太空項目，他們還擁有着最多的太空站和近地軌道空域（不過這是在與其他勢力武力爭奪太空資源和月球殖民地後的結果）。一種新的可再生燃料 CHOOH被髮明出來（並不是其化學式，只是 BioTechnica市場部門想出來的招牌），在幾年內便取代了汽油的地位。雖然從南美戰爭中退役回來的殘疾老兵非常之多，但這樣的慘狀也將生物科技的發展推向了一個新的高度，結果就是 2010年到 2020年左右義體改造的大熱。
然而，隨着賽博改造的出現，自然而然地就催生了「賽博戰爭」與「賽博犯罪」，以及其他利用這項新興科技進行的反道德活動。在這樣一個麪粉成爲主要糧食的世界中，爲了食物或是其他資源爭得你死我活已經成爲常態。人們已經習慣了將腦袋別在褲腰帶上，許多人選擇成爲賽博強化的傭兵。無論是街頭小子還是公司員工，他們最終都會變成人們口中的自由業者，也就是所謂的「賽博朋克」。
在一系列崩潰和動亂中，夜之城成爲少數幾個倖存下來的超級大都市，但這裡的麻煩事兒也同樣不少。1994年建城之初，這裡被稱爲科羅拉多城，但隨後由於建築師 Richard Night被企業或是黑幫的篡權行爲暗殺而更名（具體是誰所爲至今仍是一個謎）。這座城市直到 2010年代才終於走向穩定。在經歷了公司安保部隊與匪幫長達數年的街頭戰爭後，犯罪組織最終宣告敗退。雖然夜之城仍是一個高度危險的地方，一些街區，例如並未建完的太平洲從未在戰爭後恢復過來，但至少整個地方更像一座城市，而不是一個每天打仗的戰區。不過，這樣的和平只持續了短短几年時間。
2013年，搖滾明星兼賽博朋克強尼·銀手——他是一位 90年代中美州戰爭的老兵，用一條鍍鉻的假手來代替自己因傷殘疾的左臂而得名。他當時正和自己的女友奧特一起開辦演唱會，突然被公司的小隊襲擊。他們留下銀手等死，並綁架了奧特，將她帶回荒阪集團的總部。這是因爲荒阪集團並不滿足於自身現狀，成爲制霸全球的數個超級公司之一還不夠，公司的成立者荒阪三郎和他兒子想要的統治全球。此時的強尼·銀手並不知道自己的女朋友是一名非常厲害的網絡黑客，正是她設計出了一款被稱爲「靈魂殺手」的惡意軟件。
這個軟件原本用於將一個人的意識轉移到克隆的軀體內，但被別人進行了武器化改造，不僅能用來燒焦目標的大腦，還能囚禁並折磨他人的數字化靈魂。這個程序是現代最道德敗壞，最惡毒的發明之一，但同時也是人類獲得永生的關鍵。不過荒阪集團綁架奧特更多是爲了前者，而不是爲了獲得永生。
與此同時，銀手從襲擊中倖存了下來，並組建了一個救援小隊。他們在荒阪公司門前開辦了一場即興演出，並鼓動現場人羣發起暴動，從而進入荒阪公司。這時，奧特啓動了靈魂殺手，將自己的意識數字化逃脫，但是兩人的計劃互發生了致命衝突。
強尼和他的隊友們衝進荒阪公司，無意中摧毀了一個連接網絡與肉體的控制主機，導致奧特的意識被困在數字空間中沒法逃脫。他們認爲奧特已死，便逃出了這裡，留下奧特殘缺的意識困在網絡空間中。
2020年之前已經有過三場公司戰爭，當一個企業坐擁小型國家的 GDP與軍事力量，爲了爭奪市場霸權而大打出手是必然發生的事情。但是，之前的三場戰爭與第四次公司戰爭相比那都算是小巫見大巫。
事情的起因很簡單，至少對比公司之間的各種間諜滲透來說已經算簡單了。2021年，一家跨洋船運公司想要惡意收購競爭對手。然而雙方之間的衝突愈演愈烈，分別僱傭了兩家最大的私人軍事公司荒阪與軍用科技來對決，而這兩家企業互相之間的敵意也早就醞釀多時，只等一個合理的藉口來一決高下。
夜之城是這場戰爭結束的原爆點。作爲一個自由邦中的自由城市，軍用科技和荒阪集團在城內都設有自己的要塞，沒有了政府的管轄，這裡自然成爲了雙方交戰的核心地帶。最終，在 2023年 8月，隨着一顆小型核彈在荒阪集團總部引爆，這場戰爭達到了高潮。