而在中國的土地上，類似於上邊所說的讓非信教民衆吃虧的教案影響很壞。
加上一些別有用心的人造出很多謠言，比如說外國人的醫院專挖中國小孩的眼睛製造**，神父用特製器具吸取小男孩身上的什麼東西之類的等等。
當時因國人缺少科學知識，一般中國百姓很容易相信這類傳言，形成了一股很強烈的仇外、排外情緒。
一些爲非做歹的人趁機搶奪教會和教民的財產，形成更多的教案；義和團也藉機打出了滅洋的旗號。
一開始，由於山東的教案頻繁，義和團活動猖獗。爲了維護山東的社會治安，朝廷命袁世凱帶他所部的武衛右軍到德州和沂州等地操練，試圖對匪患形成震懾。
有一起很出名的教案。
一八九九年十月七日，平原縣槓子李莊的，一楊姓爲首拳民、搶劫了本莊李姓教民家的財物。
李姓教民到縣控告。縣令蔣楷派總役陳德和帶領縣勇前往抓捕。
李姓拳民等羣起抗拒，經過莊民協助，拿獲邱姓拳民等六人。
蔣楷提訊。邱姓全民等供認聽從李姓全民，搶奪李姓教民家糧食衣物屬實，遂命將六人拘押。
李姓拳民逃走，立時向在這一帶活動的義和拳的大首領求援。
大首領率衆來到槓子李莊，又對教民搶劫了一次。綁架教民，聲言必須將邱被子等六人放回。還誣陷陳德和訛詐李姓拳民錢文，必須如數交出，否則將教民殺盡。
蔣楷親帶領勇隊前往，兩名差伇被砍傷。蔣楷見對方勢大，報請上方求援。
這時，袁世凱剛好帶武衛右軍在這一帶操練。
十月十六日，濟南知府盧昌詒和袁世凱帶部前往，抵達平原。
當時的山東巡撫是毓賢，是個極端頑固的排外派，他對義和拳是袒護的，要求下邊對義和拳主要是撫。不到萬不得已，不得對義和拳動武。
盧昌詒將毓賢的告示，派人送義和拳大首領，勸其解散。
義和拳大首領倚仗人多勢衆，抗拒滋鬧如故。
十八日，義和拳大首領率部移駐森羅店。
盧昌詒擔心釀成更大的禍害，再次派人勸諭他們醒悟解散。同時和袁世凱帶部前往，以示震懾。
義和拳大首領見官軍到來，想先下手爲強對官軍展開攻擊，官軍有傷亡。
袁世凱下令部隊進行攻擊，並派馬隊包抄。兩路夾擊，擊斃拳民二十多人。
義和拳大首領見不敵，帶人逃串。
極端仇外的山東巡撫毓賢，接到盧昌詒的稟報，不問青紅皁白。按着慣性思維，馬上斷定知縣李楷袒護教民；且縱惡役陳德和訛詐百姓。以致激起衆怒，盜匪乘機搶劫。
奏請將蔣楷革職，陳德和提省嚴辦。
對袁世凱也大爲不滿，認爲是他破壞了自己的招撫義和拳的的總體大計。向上參奏了袁世凱一本，請求朝廷將袁世凱的武衛右軍，調離山東。
這樣一來，反而把袁世凱堅決鎮壓義和拳的名聲傳了出去。
義和拳大首領等逃回茌平，與手下的幾個其他首領經過一番協商。覺得事情已經鬧大，乾脆帶人出去四處搶劫教民。
先後搶劫了禹城縣苗家林莊教民王書紳等四家，並殺害了一名看門的平民。
搶劫了長清縣李家莊教民李公堂家，並綁架了李公堂之父與弟勒贖。
搶劫了鄭家營教民鄭繼先等人，綁架了其父。
搶劫了茌平縣張官屯徐清華等家，將教堂教師王觀傑殺害。
搶劫了王香老莊教民徐養蘭家，綁架馬家沙窩莊教民劉安義父子勒贖。……
事情越鬧越大。但毓賢看搶得大多是是教民，仍然法外施仁，不咎既往，令其解散。
事情傳到朝廷，朝廷嚴令毓賢嚴加懲處義和拳大首領等匪首。
毓賢不得不命道員吉燦升和副將馬金敘率領所部官兵剿匪。
十一月二十一日將義和拳大首領抓捕，而後又把另幾個首領捕獲。
毓賢對義和拳的這些首領等進行了審問。
發現這幾個人的所作所爲，和他腦子裡形成的思維定勢的教案無任何關係，這些人的確是以教案爲藉口殺人越貨、搶掠財物作惡多端的劫匪。想到自己一直在袒護這夥強盜，怕落人口實，也迫於各個方面的壓力，匆匆忙忙把義和拳大首領等首惡處死。
各國列強對毓賢不能保護教堂，引發教民的極大不滿，強烈要求清**撤換山東巡撫。
清**也認爲毓賢“固執己見，以爲與教民爲難者，即系良民，不免意存偏袒，似此因循日久，必滋生事端”。
一八九九年十二月二十六日，命毓賢進京陛見，
由袁世凱署理山東巡撫。
袁世凱目賭山東亂像，不願意接毓賢的亂攤子。
進京請訓時提出，因山東治安不好，奏請自己仍舊節制武衛右軍。得到批准，便帶領本部人馬去山東上任。
到任後，袁世凱面臨的是兩大難題：
一個是高密的民衆阻止德國人修築膠濟鐵路，另一個是遍佈山東全境的義和團的活動。
袁世凱早就在骨子裡認定，義和團之類的是匪患。這也很正常，他的家族本就是靠鎮壓農民造.反中興的。
因此，他在上任途中，路經德州接見吳橋縣令，高度評價其請明旨懲辦拳匪的舉動，並電促直隸總督裕祿上奏。
到任的第二天，他就先下手爲強，頒佈了《禁止義和拳匪告示》。在告示中曉之以情，動之以理：“統帥重兵彈壓鎮撫，原不難立加撲滅，究不忍不教而誅”。
除公告前任毓賢已將義和拳大首領等正法外，特出示曉諭軍民人等一體知悉：
“務宜互相勸誡，守分安常，……毋誤墮於迷途。其已入拳教者，痛改前非，立時解散；其未入拳教者，勿復附從。有能激發天良獻首者，定以自新之陸並獎其除霸之功；如其執迷不悟，怙惡罔悛，是乃甘蹈刑章，定當嚴緝懲治。
“或敢包庇匪首，隱匿不報，一經發現，定將窩主按律科罪，並將裡保一併究懲。倘再目無法紀，持衆抗官，大軍一臨，玉石俱碎。本署撫部淳淳苦心，勿謂言之不預也。”
對於袁世凱出任山東巡撫，各國列強是比較滿意的。
比如英國駐京公使竇納樂致函英國外交大臣索爾茲伯理說：“關於山東北部的局勢，我認爲，最有希望的前景是挑選袁世凱充任山東巡撫。
“這位官員曾擔任多年的駐朝鮮大臣的職務，並且最近統率駐天津附近受外國人訓練的軍隊約八千人。
“他已經宣佈，必須把全軍隨他調往該省：同時，他性格果斷，而且在必要時立即使用武力，這是他一生中在各種危急形勢下進行活動的特點。所以使人們可能期望，在他管轄的省份中，他將順利地迅速平定叛亂。”
禁止義和拳的告示發出後，袁世凱找來手下的提督程文柄商量剿匪事宜。
程文柄一再搖頭，說義和拳很多人有神功附體，刀槍不入，實難對付。
好意的勸說袁世凱，佈告發出去做做樣子就算了，別給自己找不必要的麻煩。
義和拳真有神功附體嗎？袁世凱是個很迷信的人，但他更相信耳聽爲虛，眼見爲實。他回憶起那次和濟南知府盧昌詒在剿殺義和拳時，打死拳匪二十多人，沒見有誰刀槍不入呀！但程文柄一口咬定他是親眼所見，說的活靈活現，袁世凱也不能全然不信。
如果這些義和拳的拳民真的是有神功附體而刀槍不入，還真的不好對付，袁世凱很糾結。