月20日，國民政府大本營正式發佈命令，任命唐生智爲南京衛戍司令，組建南京衛戍司令部，拉開了南京會戰的序幕
孫百里早在月日就接到大本營的命令，要求十九路軍堅守吳福線兩週以上，爲南京會戰爭取足夠的時間來集結兵力如果單純從軍事的角度來看，南京的確是個非常難以防禦的地方，唐生智居然敢一力承擔下來，這份勇氣讓孫百里非常佩服，其後，唐生智在記者招待會上的表態是使孫百里對他刮目相看唐生智說道：“本人奉命保衛南京，至少有兩件事是有把握的：第一，即本人所屬部隊誓與南京共存亡，不惜犧牲於南京保衛戰中；第二，此種犧牲定將使敵人付出莫大之代價”
另外，唐生智爲了表示破釜沉舟、背城借一的必死決心，要交通部長俞飛鵬把下關至浦口間的渡輪撤退，禁止任何部隊和軍人從下關渡江，並通知在浦口的第一軍，凡由南京向北岸渡江的任何部隊或者軍人個人必須制止，如不聽勸阻的話，可以開槍射擊唐生智的講話經報紙報道之後，在社會引起強烈反響，聲望急劇攀升，民衆開始期待着國軍能夠在南京痛擊日軍
然而，孫百里看了唐生智上任之後的兵力部署之後，立刻對這位素未謀面的訓練總監產生了懷疑，因爲劃歸南京衛戍司令部的部隊已經達到十幾萬，可是還是全部配置在南京的周邊地區，而在十九路軍後方的錫澄線卻沒有部隊駐紮這樣一來，只要日軍願意，隨時可以從兩條防線之間登陸，夾擊十九路軍，在腹背受敵的情況下，別說堅持兩週，恐怕自保都有問題
孫百里急忙把自己的意見寫成詳細的電文，向大本營報告，希望督促唐生智調整部署，重視錫澄線的防禦結果，大本營卻把孫百里的電文直接轉交給了唐生智唐生智看完之後，立即給孫百里回電，稱由於兵力不足，無法把防線推進到錫澄線，如果擔心後方的安全，可以後撤到錫澄線佈防，南京衛戍部隊就可以隨時進行支援孫百里意識到自己不可能從唐生智那裡得到任何幫助，只好先做打算了
隨後，孫百里立即召開軍事會議，商討如何在沒有後援的情況下防守吳福線這時候，十九路軍收攏的潰兵已經達到兩萬餘人，其中原本隸屬於中央軍的有五千餘人，川軍的則將近一萬人，其他的都是些地方部隊爲了方便指揮，孫百里把中央軍全部劃歸高山峻，川軍則給了向文彬向文彬和高山峻理所當然地代表收攏的中央軍和川軍參加了會議
孫百里簡單地介紹了唐生智對防禦南京的具體部署，然後說道：“南京的地形本來就易攻難守，日軍又有強大的海軍助陣，隨時可以封鎖長江，切斷後方的補給線和撤退的道路，唐生智卻把兵力收縮在南京附近，擺出一付捱打的架勢，仗還沒有打就已經輸了三分如果我們真的撤退到錫澄線佈防，衛戍區的部隊連整補的時間都沒有，如何和日軍抗衡？我看了一下，南京衛戍司令部下屬的部隊大多數都是淞滬會戰撤下來的，其中第88師和第87師損失的兵員比例高達50%，並且都是有經驗的老兵，戰鬥力肯定會受到很大的影響，最需要時間來修整部隊因此，我決定留在吳福線抵禦日軍，爲後方部隊爭取時間，希望你們支持我”
高山峻畢竟是第87師的人，立即表示同意，說道：“我支持孫將軍的決定，同時也感謝十九路軍弟兄的好意高某誓與吳福線共存亡，一定要把日軍拖在這裡兩週以上”
鍾武說道：“如果日軍真的從後方登陸，夾擊我軍，豈不是連退路都沒有了？”
孫百里回答道：“謝長風的補充師不日就會趕到，由他進駐錫澄線掩護我軍後方，向文彬、高山峻兩位老弟也率部前去增援，這樣一來，也有將近三萬人日軍如果還想抄我軍的後路，至少要出動一個師團的兵力才行”
向文彬和高山峻急忙說道：“吳福線必然是日軍首先攻擊的目標，我們怎麼可以後撤，把十九路軍單獨留下呢？”
孫百里安慰道：“二位的心意我是明白的，但是收攏的部隊軍心不穩，迫切需要修整，何況，很多弟兄連武器都沒有，留下來只會增加傷亡，沒有任何益處謝長風會運送一批武器裝備過來，你們先補充一下，如果日軍沒有登陸，只是從正面進攻的話，還可以上來增援的嗎”
李從文不放心地說道：“如果日軍從太湖的右側直接攻擊南京，而只用少量的部隊在這裡牽制我們，佔領南京之後，再從後面包抄，即使我們守住了兩道防線也沒有用”
劉謙說道：“應該不會出現這種情況日軍難道就不擔心牽制的部隊被我們擊破，然後揮師東下攻取蘇州，進而威脅上海嗎？”
孫百里讚許地點點頭，說道：“劉謙說得很對，日軍應該沒有這麼大的膽量如果蘇州被我們給奪回來，日本政府損失的就不單單是面子了”
鍾武說道：“以吳福防線工事的堅固和我軍的戰鬥力來看，堅守兩個周應該是可以的，但是如果太湖南路首先被敵人擊破，南京失守，我們往哪裡退呀？”聽了鍾武的話，其他幾個指揮官全部把眼睛望着孫百里，顯然都非常關心這個問題吳福線左靠太湖，右臨長江，雖然利於防守，可是卻不好撤退，如果後路被堵，形勢就非常危險了因爲日軍控制着長江，是不可能渡江北逃的
孫百里看了看大家，用沉穩的語氣說道：“我的計劃是，一旦後路被堵，就集中兵力，擊破當前之敵，然後攻佔蘇州，接着佯攻上海，往浙南轉移”