“三個問題，但主旨相似，問題合併，神樹病毒的起源並未被刪除，距今十年零三個月兩天十五小時三十分五十秒，神樹病毒被神樹集團的研究人員發現，那是一種寄生在樹木當中的微生物，對於特定樹木有着催生作用，使得一些樹木生長迅速且質地堅硬，各項能力超過其他同科植物，因最初只作用於樹木，與神樹集團名稱相合，故命名爲神樹病毒。”
什麼！竟然不是由魔神提供，而是神樹集團自己發現並進行研究的？對於這個答案，何平很驚訝，看來神樹集團雖然是魔神的傀儡，但是在魔神那麼多高科技的薰陶之下，就算是一頭豬估計也要開竅了，所以就算是沒有魔神，神樹集團的生物技術也是這個世界當中最頂尖級的，除去魔神讓他們所做的那些事情之外，他們也有自己的項目。
在發生生化危機之前的這一段時間裡，神樹集團一直在對神樹病毒進行研究，這基本上已經完全成爲了他們的主要研究項目，其他的研究項目基本上處於停滯狀態，甚至連活體兵器這個由魔神直接佈置的任務都沒有被積極的進行，活體兵器雖然已經研究成功，但實際上還有很多缺陷，在那些缺陷尚未克服的情況下，活體兵器也就只能在地下室噹噹保安而已，並不能達到上戰場的預期目標。
神樹集團在研究神樹病毒，神樹病毒並不是魔神的技術，神樹集團的其他研究項目幾乎處於停滯狀態，如果將這些信息全部串聯起來，倒也能夠勉強的認定爲魔神要毀滅神樹集團的動機，簡單的說，神樹集團在這段時間裡應該是沒有按照魔神的命令行事，而是在利用魔神所提供的技術支持來幹自己的事情，這樣的行爲很可能激怒了魔神，從而讓魔神痛下殺手。
僅僅只是沒有按照自己的意願行事就要大開殺戒。並且不只是毀掉了神樹集團這個扶持已久的傀儡，甚至連整個世界也都遭到了池魚之殃，大量的生物差點完全毀滅，若是那樣的話。剩下的生物重建生態體系，然後重新發展起來不知道又要多長時間，這對於一個世界來說，無疑是相當嚴厲的懲罰了。
何平不瞭解魔神，對於魔神的認知。僅僅限於在精靈界當中所接觸到的一些線索，至於在生化墓園，現在看樣子魔神已經完全遺棄了這個世界，已經幾乎沒有了任何魔神與這個世界有勾結的線索，相關的數據被刪除，神樹集團全面崩潰，就算有活體兵器，有巨大生物，還有生物計算機，但沒有了能源的供給和人員的維護。死亡也只是個時間問題了。
魔神竟然如此的殘暴？不管怎麼說，魔神應該也是一個至少五級的文明，作爲一個高等文明，應該不會遺留很多原始時期的習性纔對，儘管有點以己度人，但何平還是覺得一個高等文明最起碼的素質就是對生命的尊重和寬容，若是那般殘暴和狹隘，文明本身就很難發展起來，就像精靈界的半獸人，若是想要進步。就必須多一點像是劍聖阿薩姆一般的智者才行，而像是門多薩和多米尼克那樣的傢伙，不論有多少，不論實力多強。都沒有什麼促進作用。
那麼問題來了，魔神爲什麼要痛下殺手，毀掉神樹集團和這個世界？動機，表面上看是神樹集團身爲傀儡，沒有按照魔神的命令行事所致，實際上呢？何平將目光放在了神樹病毒上。神樹集團在最後的日子裡，所有的注意力都是放在神樹病毒上的，那麼是不是可以推斷，魔神毀滅神樹集團的原因不是神樹集團不聽命令，而是神樹病毒本身？
神樹病毒究竟有着什麼樣的威力，能夠讓魔神如此恐懼，竟然不惜毀掉自己一手培養起來的傀儡，不惜毀掉整個世界，也要將病毒毀掉，又有着什麼樣的魅力，讓神樹集團明知這樣做可能會激怒魔神，從而遭到滅頂之災，卻依舊毅然決然的違逆魔神的命令，將所有的精力都放在神樹病毒上，以至於其他研究項目全部荒廢？
所以到了現在，一切的關鍵又都回到了神樹病毒上，只有知道了神樹病毒的更多資料，才能夠弄清楚神樹集團究竟想要利用這種病毒做些什麼事情，同時也能夠弄清楚神樹集團所做的事情對於魔神來說又意味着什麼，只有弄清楚了這些，才能夠知道生化危機的所有真相，而想要弄清楚這些問題，關鍵，依舊在生物計算機身上。
“新的問題。”何平說道：“神樹集團對於神樹病毒的研究到了什麼階段？若是能夠達成神樹集團所期待的結果，到時候又會變成什麼樣子？”
“第一個問題，神樹集團的研究人員已經能夠控制病毒的繁殖速度，並且能夠根據不同的培養液來培養不同種類的病毒，經過一些動物實驗，但所有用作實驗樣本的動物都以死亡並被病毒支配而結束，失去自主意識，因此還沒有進行人體臨牀試驗的條件，大部分的副作用尚未祛除，不具備實際上的實用性。”
“第二個問題，信息不足，無法準確判斷，根據現有信息進行分析推斷的結果，神樹集團在沒有外界打擾的情況下，集合所有研究人員和研究設備，在‘我們’的幫助下，預計要花費至少二十年的時間才能夠獲得初步成果，進行人體臨牀試驗，屆時，預計結果爲，接受病毒改造的人類將擁有更加強大的身體和意識，更加高超的智力，自愈能力和應激反應能力。”
生物計算機列舉了不少的提升項目，不過何平所注意到的只有兩個，那就是意識和智力，其他的無所謂，提升了也對於魔神來說沒有任何威脅，但若是意識提升，那就意味着精神力的提升，精神力提升了，那麼對於神樹集團擺脫魔神的束縛就有了很大的幫助，而智力的提升則能夠幫助神樹集團更快速的消化魔神的技術，這兩項提升對於魔神來說，確實無法接受。(。)