獲得克羅格腦袋裡面存儲記憶的組織，尼克就建議奈特去到芳鄰鎮，想要通過記憶存儲庫裡的阿馬利博士獲取更多的信息，這明顯也是環環相扣的情節，不然哪裡不拿，偏偏就拿隱藏在腦海中的合成物。
不過卻是遇上了楚其琛，這是尚恩計劃中出現的一個變數。
等一行人如願的獲得更進一步的信息，那就是去發光海找到叛變的學院科學家維吉爾。
到這裡，男配角三號——維吉爾登場。
維吉爾雖然是一個比較膽小的科學家，但內心良知不允許他繼續FEV實驗，屢次要求停止FEV計劃都被拒絕，而這個計劃是聖父也就是尚恩堅持要搞的。
鑽石城裡的謠言說學院抓人去做合成人了，其實是對的也是不對的，往人體裡插晶片（像克羅格那樣）是上一代領袖（沃克博士）的做法，而老尚恩則反對這個路線。
他喜歡的是第三代合成人（畢竟是自己的DNA所構成），同時而抓人是用做FEV秘密實驗，並且已經持續了十年。
而FEV病毒是戰前英克雷搞砸的戰爭武器，地面上那些變異動物，包括超級變種人，都是FEV感染的後果，即便到後來也沒搞出什麼好的改進，無論是出於批量性殺掉或者拯救這些變異怪物以及聯邦人，都似乎說不過去，畢竟學院本來就看不起當地面上的人。
到後面，維吉爾才借用實驗事故，在自己體內植入FEV病毒，變成不怕輻射的超級變種人，逃出學院後躲到發光海里面。
其實維吉爾的逃亡也不能說是意外，說實話，要不是學院有意隱瞞了他的逃亡事件，讓其他科學家都認爲他死於實驗事故，他一個原本手無縛雞之力的變種人科學家怎麼可能逃出深埋在地下的學院。
而他的逃亡路線，其實也一直在學院的掌控之中，通過死掉的克羅格腦海裡面的記憶指引給奈特知道。
甚至可以說，這克羅格儲存的記憶也是經過加工和挑選的，從他孩童時候到青年、中年等等經歷一一節選出來呈獻給奈特瞭解讀取，而且都是對他人生影響相當大的關鍵節點，還有最重要的與小孩尚恩生活的情景以及學院科學家的維吉爾的行蹤，讓奈特有動力以及目標追蹤下去。
不然按道理來說，即便是記憶讀取，也應該是雜亂無章的，不可能這麼條條有理，就像是在看紀錄片一樣，而且也少了他替學院幹髒活的大量記憶，那可是足有六十年的時間，就這麼湊巧‘丟失’了？
那隻能說呵呵了。
更何況還有尼克湊合到這裡充當讀取播放器，學院要對這兩者動手腳簡直不要太方便了。
當然，有一個特殊狀況，就是尼克受到克羅格記憶的影響，讓奈特起了懷疑的心思，纔沒讓他一同去發光海，不然以尼克這幾乎沒有什麼電磁防護力量的軀體，去了就等於是送死。
不過現在有了楚其琛，也算是提前退場了。
而維吉爾最重要的作用，自然是給奈特提供進入學院的方式，實際上如果聽過墨菲老媽的第三次‘預言’，也同樣是這樣提示他：“你正在往海里走去，但你怕的不是溺水，而是別的東西……無形……但……有光……它燒掉裡頭的一切，但……不……我可以感覺到他們。裡面有人。在呼喚着什麼，唸誦着。他們會替你指點方向……但……他們很難看透……在他們身邊要小心一點，孩子。”
看，分明就是發光海里面的情況以及原子神教的那些神經病啊！
而緊跟着維吉爾上場的，自然是這場戲劇的最重要的道具之一——Z2-47。
沒錯，這就是那個在聯邦理工廢墟追蹤到的那個追獵者，這是最好控制的一個了，在奈特來到地盤後，才放出這個追獵者去追蹤那逃跑的合成人珍妮。
不然怎麼可能這麼湊巧，剛來到這裡，就有追獵者在學院附近執行回收任務。
這也是尚恩對奈特最後一個戰鬥考驗，看能不能在學院最傑出的殺戮機器手中獲勝，這也是對學院科技的一種戰勝。
甚至墨菲老媽的第四次預言中，就有提到這個追獵者的情報：我看見你……是個強大的獵人……只不過你獵的不是動物，也不是人。是不一樣的東西。也許是超越人類的東西。但……這是什麼?我看見一個全身白裝的男人。站在你的獵物前。他在說話……聽不太清楚……但我正在努力，孩子……他說【Z2—47，重置原廠設定。授權碼：Zeta53kilo】……然後他倒了下來……一動也不動……
實際上，還真有可能直接通過說這番話，讓這個追獵者像那個合成人尚恩一樣停機，這樣就可以避免一場惡戰，當然也有可能需要語音識別。
不過可惜，它遇到的是戰鬥能力非人存在的楚其琛，交手沒幾招就領便當去了，完全沒有展現其能力所在。
緊接着的便是破解這個追獵者晶片的途徑，有且僅有鐵道組織這個地方。
原本鐵道組織的頭領戴斯德夢娜對他們是否進入學院挺猶豫的，卻有一個人極力支持，這個人叫做迪耿，同樣也是合成人！而且還不是失去記憶的那種，就是一個合成人特工！
沒錯，專門從學院手中拯救合成人的鐵道組織，早就混入了學院的特工！
其實想想也知道，學院的合成人時不時就失蹤幾個，被鐵道組織的人救出去，學院的人真的不會徹查這麼詭異的情況？僅僅是派出追獵者將他們回收回來就算了？
這是壓根不可能的事情！
即便這些學院領導者情商再低也不會，更何況以尚恩不是死腦筋的領導人，能夠一環扣一環的對奈特施加各種考驗引到學院來，就更加不會讓這種事情發生。
就等於財主眼睜睜看着老鼠從牆角的洞那裡鑽進來偷糧食，卻不去想着把洞堵起來？
若果真的是這樣，要麼就是別有用心，要麼就是想着將老鼠一家一棒全部打死！