先前說過，淄州刺史曹全晸被免了招討使之職，但以其地距黃巢不遠，不忘爲朝廷盡忠的他還是主動上表請求擊賊。這讓田令孜一衆很是羞愧。唐僖宗大喜過望，便任命曹全晸爲天平節度使、兼東面副都統，使其集合諸路軍討黃巢。
又到了秋季，天清氣爽，百草豐茂。衆花已謝，唯有菊開遍地金黃。自幼便以黃色爲自己本命色的黃巢望着那滿目的金燦之光，再想想自己已擁有數十萬兵民，豪氣頓生！他大擺宴席三日，犒勞軍士。自己詠詩一首“
待到秋來九月八，我花開後百花殺。沖天香陣透長安，滿城盡帶黃金甲。”黃巢準備在今年完成自己的最終目標。
在九月時，黃巢率領號稱十五萬的兵衆來戰曹全晸。曹全晸只有六千兵力，因衆寡不敵，便退屯到泗水上，想等待諸軍齊至後，再併力擊之。然而各路兵都畏懼不敢前來。就連距離其最近，僅有數十里地的高駢也不派兵相救。曹全晸嘆道“國難臨頭，各將仍擁兵自重，坐使賊猖獗如斯！我看大唐三百年社稷，終要亡於賊手。我不忍見到國破時的悲涼景象。今日能爲國盡忠，或許正是上天的恩賜！”曹全晸孤軍陷入重圍，全軍覆沒。在躍馬橫矛突圍數次都不得出後，曹全晸也戰死於陣。
之後黃巢帶領所有部衆渡過淮河，開始經略中原。數年來，黃巢與官軍作戰無數，他見到無數兵民死於戰鬥與饑荒，哀鴻遍野、市井蕭條的悽慘景象處處皆是。由此他深深的考慮了一番，覺得若要平定天下，絕對不能只看眼前，貪圖一時之財而亂搶亂奪。更何況如今的財富已經足夠豐厚了。只有深得民心才能獲得長久的安定。於是他準備給兵士們申明紀律。
進軍中原前，黃巢大閱兵士。他誓師道：“諸位弟兄們，我們自起義以來，歷經無數惡戰，才終於有了今天的成就。你們跟着我，圖的是什麼？不就是圖的能吃飽飯，過上好日子嗎?可是，如果我們到處去搶平民百姓，使其遭受我們曾受過的飢寒之苦，我們又於心何忍呢？我們絕不能那麼自私。想我們起義的初衷就是爲的天下勞苦大衆都有飯吃。從今日開始，我要嚴明紀律，誰也不得去搶平民財物，不得擄掠良人，更不得濫殺無辜！有違此者斷不輕饒！要搶，我們該去搶誰？搶李家的江山，搶朝廷的貪官污吏！我們已進軍中原，只要我們萬衆一心，勇戰而前，估計不日即可拿下兩都。數不清的珍寶財富就在眼前，到時平分天下財產，使得普天之下再無窮人！兄弟們，跟隨我一股作氣，火速攻下長安！今年我們就在長安城過大年，怎麼樣？”“好好好！”軍士們歡呼，萬聲雷動！
進軍中原後，黃巢之衆果真再不擄掠。他們每到一州，先派人逼迫鎮守的官員打開官倉，拿出糧食來犒勞軍隊，黃巢還將貧民聚集到一起，分給他們糧食。願跟隨黃巢軍隊的，選其少壯者。然後隨即離開此地。若有不聽命令的州縣，即刻攻下。但若有個別極難攻克者，也不停留，放棄攻打繼續前進。
這樣一來，黃巢一路勢如破竹，很多州縣望風降附，所過皆下。攻陷了申州，進入潁、宋、徐、兗之境後，於十一月進入汝州，汝鄭把截制置都指揮使齊克讓望鋒奔潰。黃巢開始逼近東都洛陽，使人向諸藩鎮軍隊傳達：“請各自守好本土，勿犯吾鋒！吾將入東都，再到長安，問罪李儇，其他人等一概無關！”
消息傳到朝廷後，人人震駭。唐僖宗急忙召集諸大臣議事。大家多面面相覷，唐僖宗覺得極其無助，懼怕至流淚。見此情形，崔沆與豆盧琢率先發話，他們請求急發關內諸藩鎮兵和左右神策軍去鎮守潼關。鄭畋也說道，“請陛下親自以忠義激勵將士，與賊在潼關決一死戰。或許能轉危爲安。”田令孜說道：“神策軍都是些侍衛將士，從未經歷過戰陣，恐不足用。”他心中想的是讓唐僖宗去蜀地避難，又說道“當年安祿山構逆，唐玄宗幸蜀以避之。”崔沆與豆盧琢都是賄賂田令孜而得官，這時崔沆附和着說道：“安祿山之衆相比今之黃巢，微不足道。當年哥舒翰以十五萬衆尚不能守潼關，如今黃巢衆六十萬，而潼關又無哥舒之兵。潼關不守，長安豈是安全之地？”豆盧琢也附會道“田軍使所言的確爲社稷計，況且蜀地三川帥臣都是其腹心，相比於玄宗，準備還更加充足。”唐僖宗無奈，但爲今之計也只有幸蜀最爲保險了。他對田令孜說道“爲朕幸蜀做準備吧！但潼關亦不得不派兵以守，使賊長驅直入長安。萬一能阻住黃賊，或許長安之宗廟尚可保全！勞煩阿父爲朕發兵守潼關。”
唐僖宗親自登樓閱兵。他使田令孜推薦的張承範爲兵馬先鋒使兼把截潼關制置使，王師會爲制置關塞糧料使，趙珂爲句當寨柵使，田令孜爲左右神策軍內外八鎮及諸道兵馬都指揮制置招討等使，楊復恭爲副使。
十一月十七日，黃巢攻陷東都，東都留守劉允章帥百官迎謁。黃巢入城後，向民衆詢問疾苦，絲毫無犯，百姓大悅，閭里晏然，一派太平和氣的景象！
齊克讓急忙上奏道：“黃巢已入東都，臣收軍退保潼關，於關外置寨。將士屢經戰鬥，缺乏糧儲，州縣殘破，人煙殆絕。飢寒交迫，兵械朽弊，各思鄉閭，恐一旦潰去。希望能早日派遣資糧及援軍。”於是皇帝命令選兩神策軍弩手二千八百人，令張承範等帶領他們前去增援。
這些神策軍士都是長安富家子弟，他們靠賄賂宦官得以掛名于軍籍，以獲得優厚的賜予。他們平時喜奢華服飾，馳騁遊玩，憑藉宦官的勢力任俠使氣，但從未經歷過真正的戰鬥。這回聽說要去打仗，父子相聚抱頭大哭。甚至有許多人用厚金去僱傭貧病之人代替自己，而這些羸弱之人連舉起兵器都困難。這天，唐僖宗登上章信門樓親自爲他們送行。張承範向唐僖宗進言道：“聽聞黃巢擁數十萬之衆，鼓行而西，齊克讓僅以飢卒萬人在潼關外抗拒，今遣臣以二千餘人前往，以此拒賊，臣實在是感到寒心。願陛下能早日催促諸道精兵爲我們的後援。”唐僖宗說道“有勞愛卿先行，諸道兵很快就會到達。”